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Guía legal

Registro horario en vacaciones y bajas médicas

En vacaciones o baja médica no hay jornada que fichar, pero sí hay que dejar constancia en el sistema. Cómo hacerlo si ambas coinciden.

Por Ricardo Llopis Samper· Publicado el 24 de agosto de 2026

El registro de jornada obligatorio genera dudas prácticas en cuanto aparecen las vacaciones o una baja médica: ¿hay que fichar esos días? ¿Cómo se refleja la ausencia en el sistema? Aquí va la respuesta práctica para ambos casos.

Vacaciones: no hay jornada que fichar, pero sí hay que registrar la ausencia

Durante los días de vacaciones el trabajador no tiene obligación de prestar servicio, así que no existe jornada que registrar en el sentido del artículo 34.9 del Estatuto de los Trabajadores. Eso no significa que el sistema deba quedar en blanco:

  • El día debe quedar marcado como vacaciones en el sistema (no como una jornada de 0 horas sin explicación), para que el registro sea coherente si lo revisa la Inspección de Trabajo.
  • El sistema debe llevar el saldo de días de vacaciones consumidos y pendientes de cada trabajador, algo que la mayoría de software de control horario integra junto al propio fichaje.

Baja médica: el contrato queda en suspenso

Durante una incapacidad temporal (IT), el contrato de trabajo queda suspendido: el trabajador no tiene obligación de prestar servicio ni, por tanto, de fichar. Igual que con las vacaciones, el sistema debe reflejar el periodo de baja (normalmente a partir de la fecha del parte médico), para justificar por qué no hay fichajes esos días.

Qué pasa si coinciden vacaciones y baja médica

Es una situación frecuente y con jurisprudencia consolidada, tanto si la baja empieza antes de las vacaciones como si ocurre durante ellas:

  • Si el trabajador cae de baja médica antes de empezar sus vacaciones ya planificadas, las vacaciones no empiezan a contar: se pueden disfrutar más adelante, una vez recuperado.
  • Si la baja médica sobreviene durante las vacaciones, estas se interrumpen desde ese momento. Los días de vacaciones no disfrutados por la baja se conservan y pueden disfrutarse después, generalmente dentro de los 18 meses siguientes al final del año en que se generaron.

En ambos casos, es importante que el sistema de control horario permita distinguir claramente los tres estados (jornada normal, vacaciones, baja médica) y corregir un periodo marcado como vacaciones si sobreviene una baja, para que el saldo de días pendientes quede correcto.

Por qué conviene automatizarlo

Llevar esto a mano en un Excel para una plantilla grande es propenso a errores: olvidar actualizar un saldo, no reflejar bien una baja que interrumpe unas vacaciones ya aprobadas, o descuadrar el cómputo anual de días. Si tu equipo empieza a superar las 10-15 personas, un software de control horario con gestión de ausencias integrada suele compensar frente a llevarlo manualmente.

Este contenido es informativo y no sustituye el asesoramiento de un graduado social o abogado laboralista para tu caso concreto, especialmente en situaciones donde coinciden baja médica y vacaciones ya disfrutadas parcialmente.